3D ДНК сохранилась в течение 52 000 лет в замороженных останках шерстистого мамонта

Ученые полагают, что мамонт так хорошо сохранился благодаря сухому и холодному климату Сибири.

Около 52 000 лет назад в пещере в Сибири умерла самка шерстистого мамонта с косматой гривой, похожей на кефаль. Сухой, холодный климат региона высушил тело огромного существа, превратив его плоть и кожу в нечто вроде вяленого мяса шерстистого мамонта.

Теперь хорошо сохранившееся существо, прозванное Крисом Уоддлом в честь отставного английского футболиста, известного своей стрижкой в ​​стиле «бизнес спереди, вечеринка сзади», выдает некоторые секреты вымершего вида. Используя кусочек кожи около уха животного, ученые реконструировали трехмерную архитектуру его ДНК, согласно новой статье, опубликованной на этой неделе в журнале Клетка.

Этот беспрецедентный подвиг, в котором приняли участие более 50 международных ученых, предлагает новые идеи о том, как вели себя гены животного, пока оно было еще живым. В более широком смысле, их методы могут помочь поддержать сохранение ныне живущих животных и, возможно, помочь в усилиях по «возрождению» шерстистого мамонта.

«Чтобы максимально приблизиться к настоящему мамонту, нужно знать, чем (генетическая) архитектура отличается от азиатского слона», — говорит Хендрик Пойнар, биолог из Университета Макмастера в Гамильтоне, Онтарио, который не принимал участия в исследовании. НовыйУченыйКоррин Ветцель.

Двое мужчин склонились над волосатым комком

Исследователи Валерий Плотников и Дэн Фишер изучают 52-тысячелетнего шерстистого мамонта, которого прозвали Крисом Уоддлом из-за его прически, напоминающей кефаль.

Обычно после смерти животного молекулы его ДНК начинают распадаться и расползаться, оставляя после себя беспорядочную мешанину генетического материала. Когда исследователи позже пытаются изучить эту ДНК, это похоже на попытку прочитать разрозненные страницы книги, которую перевернули и встряхнули. Они все еще могут многому научиться, но эта куча генетической информации дает им неполную картину.

Однако, благодаря тому, как сохранился 52000-летний шерстистый мамонт, геометрия его генетического материала осталась на удивление неповрежденной, что позволило исследователям реконструировать его генетический код в мельчайших деталях. Для этого они использовали новую технику, известную как «PaleoHi-C», которая помогла им картировать участки ДНК и собрать геном в его первоначальной трехмерной конфигурации. В этом случае изучение древней ДНК мамонта было похоже на чтение «упорядоченной стопки (страниц) с загнутыми углами», пишет Научный американецСайма С. Икбал.

Рассматривая структуру генома, ученые могут «выяснить, какие гены были активны у конкретного животного в момент его смерти, а какие гены были подавлены», — говорит соавтор исследования Марк А. Марти-Реном, научный сотрудник Национального центра геномного анализа в Барселоне. Вашингтон ПостЛизетт Ортега.

Исследователи сравнили ДНК мамонта с геномом современных азиатских слонов. Они обнаружили много сходств — например, что у обоих животных было 28 пар хромосом — но также и некоторые важные различия. Примерно 4,1 процента генов кожи двух видов различались, включая один, связанный с ростом волос, сообщает Газета «Нью-Йорк ТаймсШивон Робертс.

Их анализ показал, что ген, отвечающий за рост волос, был более активен у мамонта, чем у современных слонов, что помогает объяснить, почему современные толстокожие лысые, а их древние предки имели роскошные локоны. Они также определили гены, отвечающие за холодоустойчивость мамонта.

Руки в перчатках, в одной руке небольшой коричневый предмет, в другой — скальпель.

Исследователи проанализировали кусочек кожи около уха мамонта.

Команде было любопытно узнать, была ли безупречно сохранившаяся ДНК мамонта случайностью и сработает ли их метод «PaleoHi-C» на других образцах. Поэтому они провели серию лабораторных экспериментов с говяжьей печенью. Они обезвоживали некоторые образцы, используя как тепло, так и сублимацию, но сохраняли другие свежими и оставляли их при комнатной температуре.

Через три дня ДНК свежей говядины распалась на мешанину фрагментов. Но ДНК в обезвоженных образцах год спустя все еще имела трехмерную структуру.

Они даже пытались уничтожить обезвоженную ДНК, используя некоторые довольно креативные методы, например, переехать ее машиной и выстрелить в нее из дробовика. Но, тем не менее, она сохранялась.

Полученные ими обширные образцы позволяют предположить, что тот же метод можно применить и к другим древним существам, даже к останкам мумифицированных людей, при условии соблюдения правильных условий хранения.

«Эта новая работа открывает новые возможности для изучения биологии вымерших видов», — говорит Эдриан Листер, палеонтолог из Музея естественной истории в Лондоне, не принимавший участия в исследовании. ХранительЙен Сэмпл. «Эта исключительная сохранность может быть обнаружена в окаменелостях, возраст которых намного превышает 2 миллиона лет, что открывает возможность исследовать биологию гораздо более древних вымерших видов, а также их связь с ныне живущими родственниками и отличия от них».